Conferir e corrigir os saldos do estoque
O saldo de um item é a soma das movimentações dele: a história do item mostra cada entrada e cada saída, para achar e corrigir a movimentação que deixou o saldo diferente da prateleira.
O saldo de um item é tudo que entrou menos tudo que saiu. Quando o saldo está diferente da prateleira, há uma movimentação a mais, a menos ou com a quantidade trocada, e essa movimentação aparece na história do item.
Alterar ou excluir uma movimentação muda o saldo do item. Alterar o cadastro muda o item, e também o preço das peças que usam o item.
O material cadastrado fica com o saldo em zero até a primeira entrada: veja se a história do material tem alguma entrada antes de mexer no cadastro.
O mesmo material cadastrado duas vezes divide o saldo entre os dois cadastros: procure o nome na busca antes de cadastrar outro.
A saída que um pedido faz no estoque leva a data do dia em que você conclui o pedido, e não a data que você escolhe para ele: o pedido com entrega em 30/08 concluído em 01/09 mostra a saída em 01/09.
Passo a passo
Comece emEstoque
Abra o Estoque e ache o item pela busca.
Cada aba tem a sua busca: Procurar por nome do material, da embalagem ou da peça. A lista vem por Nome (A a Z); a lista de ordem, junto da busca, troca para Saldo (menor primeiro), Uso recente ou Categoria. Ao lado do título, o número mostra quantos itens a busca achou.

Toque no item para abrir o detalhe.
A ficha mostra Saldo, Valor de estoque e Valor de repasse ao cliente. Abaixo do Saldo, Em estoque, Sem saldo ou Saldo negativo diz como o saldo está.

Desça até A história deste material para ver de onde veio o saldo.
A história deste material é a última seção da ficha; na embalagem, o nome é A história desta embalagem, e na peça, A história desta peça.
Todas, Entradas e Saídas escolhem as linhas. Cada linha tem o motivo e a origem, como "pela compra nº 227", a Data, a Qtde., o Valor e o Saldo após, que é o saldo depois da movimentação: procure a linha em que o Saldo após fica diferente do que você esperava.
Fornecedores do material mostra quem vende o material e por quanto, e Pedidos em aberto que incluem o material mostra os pedidos com peças que usam o material.

Se o erro estiver no cadastro do item, toque em Alterar, na ficha.
Alterar fica depois de Movimentar estoque, Registrar compra e Pesquisa de preço, e abre o cadastro do item: nome, pacote, unidade e fornecedores. Excluir apaga o item e muda o preço das peças que usam o item: use Excluir só para o item que não deveria existir. A pergunta do Excluir pede o toque em Excluir o material.

Para desfazer uma movimentação errada, toque na lixeira da linha dela.
A janela diz o que a exclusão faz e pede o toque em Excluir a movimentação: excluir uma entrada tira a quantidade do estoque, excluir uma saída devolve a quantidade, e excluir uma produção devolve também os materiais usados.
Na linha que veio de uma compra, a lixeira trata da compra. Na compra com um item só, a janela pergunta Excluir a compra Nº, e os lançamentos da compra saem do Financeiro. Na compra com outros itens, a janela Essa linha faz parte da compra Nº mostra os itens: Alterar a compra abre a compra, para tirar só o item; Excluir a compra exclui todos os itens e as parcelas.
Com parcela paga num mês já fechado no Financeiro, a janela Exclusão não permitida pede para reabrir o mês antes.

O Saldo da ficha e a história do item mostram o que ficou. Se o saldo continua diferente da prateleira, faça um Ajuste de saldo com Corrigir o saldo para o que eu contei: você escreve o total da prateleira, e o Calcularte lança a diferença, sem lançar nada no Financeiro.